Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RNASELQ05823 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNASELQ05823 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms