Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms