Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms