Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms