Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPIBQ01892 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms