Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms