Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRX1P78414 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX1P78414 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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