Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM4P67936 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM4P67936 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM4P67936 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM4P67936 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM4P67936 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPM4P67936 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPM4P67936 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms