Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms