Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms