Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms