Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms