Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms