Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THBS4P35443 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms