Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PLNP26678 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PLNP26678 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PLNP26678 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms