Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA1P25786 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms