Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms