Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DESP17661 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DESP17661 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DESP17661 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DESP17661 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DESP17661 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DESP17661 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DESP17661 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DESP17661 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DESP17661 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms