Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL2P13500 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms