Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms