Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NGFRP08138 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NGFRP08138 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NGFRP08138 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NGFRP08138 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms