Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms