Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCC9O60706 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms