Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms