Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms