Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLTPD2A6NH11 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLTPD2A6NH11 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms