Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms