Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms