Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms