Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms