Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms