Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms