Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms