Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEFF2Q9UIK5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms