Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPS1Q9UHF7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms