Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms