Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms