Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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