Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms