Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms