Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms