Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms