Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms