Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms