Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CHCHD7Q9BUK0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CHCHD7Q9BUK0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHCHD7Q9BUK0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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