Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms