Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms