Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms