Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms