Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NSMCE2Q96MF7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms